Bioinformatik-Studie über Elemente, die möglicherweise an der Reaktion auf Licht in Metarhizium beteiligt sind

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Bioinformatik-Studie über Elemente, die möglicherweise an der Reaktion auf Licht in Metarhizium beteiligt sind (Lavn Lpez Lourdes Lavinia)

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Originaltitel:

Bioinformatics study of elements potentially involved in response to light in Metarhizium

Inhalt des Buches:

Licht ist einer der konstanten abiotischen Faktoren auf unserem Planeten, und praktisch alle lebenden Organismen reagieren in irgendeiner Form auf den Lichtreiz. Ein wichtiger Aspekt nach dem Lichtempfang ist die Genmodulation; dieser Mechanismus beinhaltet die Stimulierung oder Hemmung der Expression bestimmter Gene, die möglicherweise den Zweck der Anpassung an unterschiedliche Umweltbedingungen haben. Bei Pilzen hat die Lichtreaktion eine sehr wichtige Auswirkung auf die Gene, die an der zirkadianen Regulierung beteiligt sind; in diesem Prozess regulieren die Produkte der frq- und frh-Gene die Aktivität des White-Collar Complex (WCC) in einer zeitabhängigen Weise.

Dieses Phänomen ist bei saprophytischen Organismen weithin erforscht; die Untersuchung der molekularen Komponenten und der Mechanismen, die an der Chronobiologie und Photobiologie bei entomopathogenen Pilzen beteiligt sind, ist jedoch relativ neu. Bei Metarhizium gibt es Berichte über phänotypische Effekte, die durch den Lichtreiz verursacht werden, einschließlich Wachstum bei konstantem Licht oder Photoperiode; es gibt jedoch keine vollständige Beschreibung des Mechanismus, der zu diesen photoabhängigen phänotypischen Merkmalen führt.

Aufgrund der weiten Verbreitung von Lichtreaktionsgenen in Fadenpilzen haben wir eine bioinformatische Analyse des subgenomischen Kontextes dieser Gene mit Hilfe der Software Mauve und RStudio durchgeführt. Wir fanden heraus, dass die Lichtreaktionsgene in den analysierten Genomen konstant zu sein scheinen, was eine mikrosynthetische Konservierung innerhalb der Gattung Metarhizium zeigt, mit Ausnahme des wc2-Gens. Um die mögliche Transkriptionsregulierung besser zu verstehen, analysierten wir die Promotoren der Lichtreaktionsgene auf der Suche nach mutmaßlichen cis-regulierenden Elementen und fanden konservierte Motive in allen untersuchten Metarhiuzm-Arten; dieser Ansatz ermöglichte es uns, andere mögliche Gene für die Reaktion auf Licht und die zirkadiane Steuerung innerhalb des Genoms dieser Gattung zu identifizieren.

Schließlich schlagen wir verschiedene lichtabhängige Mechanismen vor, zusätzlich zu ihren mutmaßlichen molekularen Komponenten und den Genen, die an diesen charakteristischen Phänotypen beteiligt sind.

Weitere Daten des Buches:

ISBN:9789994987252
Autor:
Verlag:
Sprache:Englisch
Einband:Taschenbuch

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Letzte Änderung: 2024.11.13 22:11 (GMT)