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Genomics in the Aws Cloud: Analyzing Genetic Code Using Amazon Web Services
Genomanalyse und Sequenzierung von Daten mit Amazon Web Services durchführen
Genomics in the AWS Cloud: Analyzing Genetic Code Using Amazon Web Services (Genomik in der AWS-Cloud: Analyse des genetischen Codes mit Amazon Web Services) ermöglicht einer Person, die nur mäßig mit der AWS-Cloud vertraut ist, eine vollständige Genomanalyse und -forschung durchzuführen. Mithilfe der Informationen in diesem Buch können Sie eine FASTQ-Datei mit Rohdaten aus einem Labor oder eine BAM-Datei von einem Dienstanbieter nehmen und damit eine Genomanalyse durchführen. Sie werden auch in der Lage sein, potenziell pathogene Gensequenzen zu identifizieren.
⬤ Eine Einführung in Whole Genome Sequencing (WGS)
⬤ Verstehen Sie WGS auf AWS.
⬤ Beherrschen Sie AWS-Services für die Genomanalyse.
Einige wichtige Vorteile der Verwendung von AWS für die Genomanalyse bestehen darin, dass Forscher eine große Auswahl an Rechenservices nutzen können, die verschiedene Datensätze in Analysepipelines verarbeiten können. Genomische Sequenzer, die Rohdatendateien erzeugen, befinden sich in Laboren vor Ort, und AWS bietet Lösungen, die es den Kunden leicht machen, diese Dateien zuverlässig und sicher zu AWS zu übertragen. Die Speicherung von Genomik- und medizinischen (z. B. bildgebenden) Daten in verschiedenen Stadien erfordert enormen Speicherplatz auf kostengünstige Weise. Amazon Simple Storage Service (Amazon S3), Amazon Glacier und Amazon Elastics Block Store (Amazon EBS) bieten die notwendigen Lösungen für die sichere Speicherung, Verwaltung und Skalierung von genomischen Dateien. Darüber hinaus können die Speicherservices mit verschiedenen Rechenservices von AWS verbunden werden, um diese Dateien zu verarbeiten.
Unabhängig davon, ob Sie gerade erst anfangen oder bereits Genomikdaten mit der AWS-Cloud analysieren, erhalten Sie in diesem Buch die Informationen, die Sie benötigen, um die AWS-Dienste und -Funktionen so zu nutzen, dass sie für Ihre Genomforschung am sinnvollsten sind.