Identification in silico des micrornas et de leurs cibles chez la lentille
In dieser Arbeit wird der In-silico-Ansatz zur Identifizierung und Charakterisierung von miRNAs, die in den ESTs (Expressed Sequence Tags) von Linsen konserviert sind, angewandt. Zur Identifizierung neuer miRNAs in der Linse wurden die EST-Sequenzen mit Hilfe von Online-BLASTN auf Homologie mit den bekannten reifen miRNAs aus dem vgtalen Reich Viridiplantae untersucht.
Die auf vergleichender Genomik basierende computergestützte Identifizierung ergab 12 potenzielle miRNA-Kandidaten, die 12 verschiedenen miRNA-Familien in der Linse angehörten. Schließlich wurden unter Verwendung der potenziellen miRNAs in der Linse insgesamt 25 Zielgene vorhergesagt und ihre wahrscheinlichen Funktionen veranschaulicht. Die meisten Zielgene der miRNAs aus der Linse scheinen für Wachstum, Entwicklung, Stoffwechsel und Stressreaktion, Krankheitsresistenz usw.
zu kodieren. In naher Zukunft könnte ein besseres Verständnis der molekularen Mechanismen der miRNA in der Linsenpflanze zur Entwicklung einer neuen und präzisen Technik beitragen, um bestimmte Mechanismen des posttranskriptionalen Gen-Silencing als Reaktion auf Stresstoleranz zu verstehen.
| ISBN: | 9786205684849 |
| Autor: | |
| Verlag: | |
| Sprache: | Englisch |
| Einband: | Taschenbuch |
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