
Die metabolische Vielfalt der Bakterien macht sie zu einer nützlichen Ressource für die Sanierung der Umweltverschmutzung. Bakterien wurden zur Beseitigung von Ölverschmutzungen, PCBs und Schwermetallen wie Arsen, Quecksilber, Kadmium und Blei eingesetzt.
Es gibt genügend Beispiele, die darauf hindeuten, dass es nur wenige, wenn überhaupt, Stoffe gibt, die nicht zumindest teilweise von Mikroben für den Stoffwechsel genutzt werden können. Der biologische Abbau ist eine attraktive Alternative zu den derzeitigen Abfallentsorgungspraktiken, da es sich im Allgemeinen um ein kostengünstigeres Verfahren handelt, das potenziell viel effizienter ist und keine sekundären Schadstoffe erzeugt, wie sie bei der Verbrennung und Deponierung entstehen. In einigen Fällen kann es sogar möglich sein, aus dem bakteriellen Stoffwechsel von Schadstoffen nützliche Endprodukte mit wirtschaftlichem Nutzen zu gewinnen, z.
B. Ethanol zur Verwendung in Biokraftstoffen.