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Next-Generation DNA Sequencing Informatics, Second Edition
Die Technologie der DNA-Sequenzierung der nächsten Generation (NGS) hat die biomedizinische Forschung revolutioniert und die Genom- und RNA-Sequenzierung zu einem erschwinglichen und häufig genutzten Instrument für eine Vielzahl von Forschungsanwendungen gemacht, darunter die Entdeckung von Varianten (Mutationen), die Genexpression, die Analyse von Transkriptionsfaktoren, Metagenomik und Epigenetik. Bioinformatikmethoden zur Unterstützung der DNA-Sequenzierung sind und bleiben ein kritischer Engpass für viele Forscher und Organisationen, die die NGS-Technologie nutzen wollen. Diese neue Ausgabe bietet eine gründliche, leicht verständliche Einführung in die notwendigen Informatikmethoden und -werkzeuge für die Analyse von NGS-Daten und enthält detaillierte Beschreibungen von Algorithmen, Stärken und Schwächen bestimmter Werkzeuge, Fallstricke und alternative Methoden. Vier neue Kapitel behandeln den Versuchsaufbau, die Probenvorbereitung und die Qualitätsbewertung von NGS-Daten.
Öffentliche Datenbanken für DNA-Sequenzierungsdaten.
De-novo-Transkript-Assemblierung.
Proteogenomik.
und neue Sequenzierungstechnologien. Die übrigen Kapitel der ersten Auflage wurden mit den neuesten Informationen aktualisiert. Das Buch enthält außerdem umfangreiche Verweise auf bewährte Bioinformatikmethoden für NGS-Anwendungen und Anleitungen für gängige Arbeitsabläufe. Diese Ausgabe richtet sich an die Informatikbedürfnisse von Studenten, Laborwissenschaftlern und Computerspezialisten, die von der Explosion der Forschungsmöglichkeiten profitieren wollen, die die neuen DNA-Sequenzierungstechnologien bieten.
(Autoren)
Alexander Alekseyenko.
Silvia Argim3n.
Brian D. Athey.
Miroslav Blumenberg.
Stuart M. Brown.
Lisa Cohen.
Efstratios Efstathiadis.
David Feny.
Jeremy Goecks.
Gerald A. Higgins.
D. Frank Hsu.
Kranti Konganti.
Konstantinos Krampis.
Guillermo I. Perez-Perez.
Kelly V. Ruggles.
Christina Schweikert.
Steven Shen.
Phillip Ross Smith.
Zuojian Tang.
Jinhua Wang.