High-Throughput Next Generation Sequencing: Methods and Applications
Teil I: Genomsequenzierung
1.Helicos Einzelmolekülsequenzierung bakterieller Genome
Kathleen E. Steinmann, Christopher E. Hart, John F. Thompson und Patrice M. Milos.
2.Ganzgenomsequenzierung von nicht kultivierbaren Bakterien unter Verwendung der Ganzgenomamplifikation
Yuichi Hongoh und Atsushi Toyoda
Teil II: Genexpressionsanalyse
3.RNA-Sequenzierung und Quantifizierung mit dem Helicos Genetic Analysis System
Tal Raz, Marie Causey, Daniel R. Jones, Alix Kieu, Stan Letovsky, Doron Lipson, Edward Thayer, John F. Thompson, und Patrice M. Milos.
4.Transkriptom-Profiling mittels direkter Einzelmolekül-RNA-Sequenzierung
Fatih Ozsolak und Patrice M. Milos.
5.Entdeckung von bakteriellen sRNAs durch Hochdurchsatz-Sequenzierung
Jane M. Liu und Andrew Camilli.
6.Identifizierung von Virus-kodierenden MicroRNAs mittels 454 FLX Sequenzierplattform
Byung-Whi Kong
7.Ribosomale RNA-Abreicherung für massiv parallele bakterielle RNA-Sequenzierungsanwendungen
Zhoutao Chen und Xiaoping Duan.
Teil III: Mikrobielle Vielfalt
8.Integration von Hochdurchsatz-Pyrosequenzierung und quantitativer Real-Time-PCR zur Analyse komplexer mikrobieller Gemeinschaften
Husen Zhang, Prathap Parameswaran, Jonathan Badalamenti, Bruce E. Rittmann, und Rosa Krajmalnik-Brown.
9. Tag-encodierte FLX-Amplikon-Pyrosequenzierung zur Aufklärung der mikrobiellen und funktionellen Genvielfalt in jeder Umgebung
Yan Sun, Randall D. Wolcott, und Scot E. Dowd.
10.Pyrosequenzierung von Chaperonin-60 ( cpn60 ) Amplikonen als Mittel zur Bestimmung der mikrobiellen Gemeinschaftszusammensetzung
John Schellenberg, Matthew G. Links, Janet E. Hill, Sean M. Hemmingsen, Geoffrey A. Peters, und Tim J. Dumonceaux.
11. Vorscreening mikrobieller Populationen zur Bewertung des Sequenzierungspotenzials
Irene B. Hanning und Steven C. Ricke.
Teil IV: Metagenomik
12.Metagenomics
Jack A Gilbert, Bonnie Laverock, Ben Temperton, Simon Thomas, Martin Muhling, und Margaret Hughes.
13.Metagenomische Analyse des intestinalen Mikrobioms von Hühnern
Taejoong Kim und Egbert Mundt.
14.Genexpressionsprofilierung: Metatranskriptomik
Jack A. Gilbert und Margaret Hughes.
Teil V: Sequenzprofilierung für die Funktionsanalyse
15.High-Throughput Insertion Tracking by Deep Sequencing for the Analysis of Bacterial Pathogens
Sandy M. S. Wong, Jeffrey D. Gawronski, David Lapointe, und Brian J. Akerley.
16.Bestimmung von DNA-Methylierungsprofilen mittels Sequenzierung
Suhua Feng, Liudmilla Rubbi, Steven E. Jacobsen, und Matteo Pellegrini.
Teil VI: Sequenzierungsbibliotheksvorbereitung
17. Vorbereitung von Next-Generation-Sequenzierungsbibliotheken mit der Nextera(TM)-Technologie: Gleichzeitige DNA-Fragmentierung und Adaptor-Tagging durch In-vitro-Transposition
Nicholas Caruccio.
18.Amplifikationsfreie Bibliotheksvorbereitung für Paired-End Illumina Sequencing
Iwanka Kozarewa und Daniel J. Turner.
19.Target-Anreicherung durch Amplifikation von Hairpin-ligierten universellen Targets für die Next-Generation-Sequenzierungsanalyse
Pallavi Singh, Rajesh Nayak, und Young Min Kwon.
| ISBN: | 9781493961641 |
| Autor: | |
| Verlag: | |
| Sprache: | Englisch |
| Einband: | Taschenbuch |
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