Perl als Einstieg in die Bioinformatik

Bewertung:   (4,4 von 5)

Perl als Einstieg in die Bioinformatik (James Tisdall)

Leserbewertungen

Zusammenfassung:

Das Buch „Beginning Perl for Bioinformatics“ ist ein Lehrmittel für die Perl-Programmierung, das speziell auf die Biowissenschaften und insbesondere die Bioinformatik ausgerichtet ist. Es ist auf Anfänger ohne vorherige Programmiererfahrung zugeschnitten und hat für seine klaren Erklärungen, praktischen Beispiele und die Fähigkeit, Programmierkonzepte zu entmystifizieren, positives Feedback erhalten. In mehreren Rezensionen wird jedoch erwähnt, dass das Buch möglicherweise nicht umfassend genug ist und veraltet sein könnte, was zu möglichen Problemen bei der Fehlersuche in Skripten führen könnte.

Vorteile:

Gut gegliedert und für Anfänger leicht zu verstehen.
Bietet eine sanfte Einführung in Perl mit praktischen Anwendungen in der Bioinformatik.
Enthält klare Beispiele und Übungen, die für biologische Probleme relevant sind.
Vermittelt effektiv grundlegende Programmierkonzepte und reguläre Ausdrücke.
Sehr empfehlenswert als Ausgangspunkt für Biologen, die das Programmieren lernen wollen.

Nachteile:

Einige Benutzer fanden das Buch zu grundlegend und nicht tief genug für fortgeschrittene Lernende.
Viele Rezensenten merkten an, dass es veraltet ist, was zu Problemen beim Debuggen von Skripten führen kann.
Einige Beispiele und Erklärungen könnten besser sein, insbesondere bei komplexen Themen.
Nicht geeignet für diejenigen, die bereits über Perl-Kenntnisse verfügen.

(basierend auf 47 Leserbewertungen)

Originaltitel:

Beginning Perl for Bioinformatics

Inhalt des Buches:

Mit seiner hoch entwickelten Fähigkeit, Muster in Daten zu erkennen, ist Perl zu einer der beliebtesten Sprachen für die biologische Datenanalyse geworden. Aber wenn Sie ein Biologe mit wenig oder gar keiner Programmiererfahrung sind, kann der Einstieg in Perl eine Herausforderung sein. Vielen Biologen fällt es schwer zu lernen, wie sie die Sprache in der Bioinformatik anwenden können. Die populärsten Perl-Programmierbücher sind oft zu theoretisch und zu sehr auf die Informatik ausgerichtet für einen nicht programmierenden Biologen, der sehr spezifische Probleme lösen muss. Mit Beginning Perl for Bioinformatics überwinden Sie schnell die Barriere zur Perl-Sprache, indem Sie das Programmieren als wichtige neue Fähigkeit im Labor betrachten und Perl-Programme und -Techniken kennenlernen, die im Labor sofort nützlich sind. Jedes Kapitel konzentriert sich auf die Lösung eines bestimmten bioinformatischen Problems oder einer Klasse von Problemen, beginnend mit den einfachsten und mit zunehmender Komplexität im Verlauf des Buches. Jedes Kapitel enthält Programmierübungen und lehrt Bioinformatik, indem es Programme zeigt und modifiziert, die sich mit verschiedenen Arten von praktischen biologischen Problemen befassen. Am Ende des Buches haben Sie ein solides Verständnis der Perl-Grundlagen, eine Sammlung von Programmen für Aufgaben wie das Parsen von BLAST und GenBank und die Fähigkeiten, sich mit fortgeschrittener bioinformatischer Programmierung zu befassen. Einige der späteren Kapitel befassen sich ausführlicher mit spezifischen Bioinformatik-Themen.

Dieses Buch eignet sich als Lehrbuch für den Unterricht, für das Selbststudium und als Nachschlagewerk. Das Buch behandelt: Grundlagen der Programmierung und Arbeit mit DNA-Sequenzen und Strings.

Fehlersuche in Ihrem Code.

Simulieren von Genmutationen mit Hilfe von Zufallszahlengeneratoren.

Reguläre Ausdrücke und Auffinden von Motiven in Daten.

Arrays, Hashes und relationale Datenbanken.

Reguläre Ausdrücke und Restriktionskarten.

Verwendung von Perl zum Parsen von PDB-Datensätzen, Annotationen in GenBank und BLAST-Ausgaben.

Weitere Daten des Buches:

ISBN:9780596000806
Autor:
Verlag:
Einband:Taschenbuch
Erscheinungsjahr:2001
Seitenzahl:370

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Letzte Änderung: 2024.11.13 22:11 (GMT)