Protein-Protein Interaction Networks: Methods and Protocols
In diesem Band werden Techniken zur Untersuchung von Interaktionen zwischen Proteinen in verschiedenen Spezies erforscht und mit kontextspezifischen Daten und der Analyse von Omics-Datensätzen kombiniert, wobei einzelne Interaktionen zu semantischen Einheiten höherer Ordnung, d. h. zu Proteinkomplexen und funktionalen Modulen, zusammengefügt werden. Die Kapitel in diesem Buch befassen sich mit Berechnungsmethoden, die verschiedene Aufgaben lösen, wie z. B. die Vorhersage von funktionellen Protein-Protein-Interaktionen.
Der Alignment-basierte Vergleich von Interaktionsnetzwerken durch SANA.
Die Verwendung des RaptorX-ComplexContact Webservers zur Vorhersage von Interprotein-Rest-Rest-Kontakten.
Docking von alternativen Bestätigungen von Proteinen, die an binären Interaktionen beteiligt sind, und die visuell geführte Auswahl eines Docking-Modells mit COZOID.
Die Erkennung neuartiger funktioneller Einheiten durch KeyPathwayMiner und wie PathClass solche de novo Pfade zur Klassifizierung von Brustkrebs-Subtypen nutzen kann. Die Kapitel sind im Format der sehr erfolgreichen Reihe Methods in Molecular Biology geschrieben und enthalten Einführungen in die jeweiligen Themen, Listen der erforderlichen Hard- und Software, schrittweise, leicht reproduzierbare Berechnungsprotokolle und Tipps zur Fehlerbehebung und Vermeidung bekannter Fallstricke.
Das hochmoderne und umfassende Buch Protein-Protein-Interaktionsnetzwerke: Methods and Protocols ist eine wertvolle Ressource sowohl für Anfänger als auch für Experten, die mehr über dieses sich entwickelnde Gebiet erfahren möchten.
| ISBN: | 9781493998753 |
| Autor: | |
| Verlag: | |
| Einband: | Taschenbuch |
| Erscheinungsjahr: | 2020 |
| Seitenzahl: | 286 |
Derzeit verfügbar, auf Lager.
