Bewertung:
Das „R Bioinformatics Cookbook“ ist ein praktisches und umfassendes Hilfsmittel, das dem Leser anhand von über 80 Rezepten eine praktische Anleitung für die Analyse biologischer Daten mit R bietet. Das Buch deckt ein breites Spektrum an Themen ab, von der Einrichtung der R-Umgebung bis hin zu fortgeschrittenen maschinellen Lerntechniken. Während es für fortgeschrittene Benutzer gut geeignet ist, können Anfänger es aufgrund der vorausgesetzten Vorkenntnisse als Herausforderung empfinden.
Vorteile:⬤ Hands-on, praktische Rezepte für reale bioinformatische Herausforderungen.
⬤ Deckt ein breites Spektrum an Themen ab, darunter RNA-seq, ChIP-seq-Analyse und maschinelles Lernen mit mlr
⬤ Enthält nützliche Tools und Frameworks wie Bioconductor und ggplot2 für die Datenvisualisierung.
⬤ Bietet ein Gleichgewicht zwischen grundlegenden Konzepten und modernsten Techniken.
⬤ Eine klare Struktur fördert das Verständnis und die Erweiterbarkeit von R-Code.
⬤ Setzt einige Vorkenntnisse in R voraus, was für absolute Anfänger eine Herausforderung sein kann.
⬤ Einige Leser schlagen vor, dass zusätzliche Themen wie Cloud Computing, Deep Learning und Einzelzellanalyse das Buch weiter verbessern könnten.
⬤ Die dichten Informationen können diejenigen überfordern, die nicht genügend Hintergrundwissen zu diesem Thema haben.
(basierend auf 3 Leserbewertungen)
R Bioinformatics Cookbook - Second Edition: Utilize R packages for bioinformatics, genomics, data science, and machine learning
Entdecken Sie über 80 Rezepte für die Modellierung und Verarbeitung realer biologischer Daten mit modernen Bibliotheken aus dem R-Ökosystem.
Hauptmerkmale:
⬤ Wenden Sie moderne R-Pakete an, um biologische Daten anhand von Beispielen aus der Praxis zu verarbeiten.
⬤ Repräsentieren Sie biologische Daten mit fortschrittlichen Visualisierungen und Workflows, die für Forschung und Publikationen geeignet sind.
⬤ Lösen Sie reale Probleme der Bioinformatik wie Transkriptomik, Genomik und Phylogenetik.
⬤ Der Kauf des gedruckten Buches oder des Kindle-Buches beinhaltet ein kostenloses PDF-eBook.
Buchbeschreibung:
Die aktualisierte zweite Auflage des R Bioinformatics Cookbook zeigt Ihnen anhand von Rezepten, wie Sie mit R praktische Forschungen und Analysen in der Computerbiologie durchführen können. Sie lernen, wie Sie eine nützliche und modulare R-Arbeitsumgebung erstellen und wie Sie Daten mit den neuesten Bioconductor-, ggplot2- und tidyverse-Tools laden, bereinigen und analysieren.
Dieses Buch führt Sie durch die Bioconductor-Tools, die Sie benötigen, um Protokolle in den Bereichen RNA-seq und ChIP-seq, Phylogenetik, Genomik, Gensuche, Genannotation, statistische Analyse und Sequenzanalyse zu verstehen und auszuführen. Im weiteren Verlauf erfahren Sie, wie Sie mit Quarto datenintensive Berichte, Präsentationen und Websites erstellen können, und erhalten ein klares Verständnis dafür, wie Techniken des maschinellen Lernens im Bereich der Bioinformatik angewendet werden können. In den abschließenden Kapiteln lernen Sie, wie Sie Schlüsselkompetenzen entwickeln, z. B. die Analyse von Genannotationen und die funktionale Programmierung in purrr und Base R. Schließlich erfahren Sie, wie Sie die neuesten KI-Tools wie ChatGPT verwenden, um R-Code zu generieren, zu bearbeiten und zu verstehen und Arbeitsabläufe für komplexe Analysen zu entwerfen.
Am Ende dieses Buches werden Sie ein solides Verständnis der Fähigkeiten und Techniken erlangt haben, die erforderlich sind, um ein Bioinformatikspezialist zu werden und effizient mit großen und komplexen bioinformatischen Datensätzen zu arbeiten.
Was Sie lernen werden:
⬤ Einrichten einer Arbeitsumgebung für bioinformatische Analysen mit R.
⬤ Importieren, Bereinigen und Organisieren von bioinformatischen Daten mit tidyr.
⬤ Erstellen von Plots, Berichten und Präsentationen in Publikationsqualität mit ggplot2 und Quarto.
⬤ Analysieren Sie RNA-seq, ChIP-seq, Genomik und Genetik der nächsten Generation mit Bioconductor.
⬤ Suchen Sie nach Genen und Proteinen, indem Sie Phylogenetik und Genannotation durchführen.
⬤ Anwendung von ML-Techniken auf bioinformatische Daten mit mlr3.
⬤ Rationalisierung der programmatischen Arbeit mit Iteratoren und funktionalen Werkzeugen in den Basispaketen R und purrr.
⬤ ChatGPT verwenden, um Code und Arbeitsabläufe zu erstellen, zu kommentieren und zu debuggen.
Für wen dieses Buch gedacht ist:
Dieses Buch richtet sich an Bioinformatiker, Datenanalysten, Forscher und R-Entwickler, die mit Hilfe eines rezeptbasierten Ansatzes mittlere bis fortgeschrittene biologische und bioinformatische Probleme angehen wollen. Arbeitskenntnisse der Programmiersprache R und Grundkenntnisse der Bioinformatik werden vorausgesetzt.
| ISBN: | 9781837634279 |
| Autor: | |
| Verlag: | |
| Sprache: | Englisch |
| Einband: | Taschenbuch |
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