Bewertung:
Dieses Buch wird für seine detaillierte Einführung in die RNAseq-Technologie hoch gelobt und ist damit ideal für Anfänger und Ausbilder in der Bioinformatik. Es deckt praktische Anwendungen umfassend ab, enthält Befehlszeilenanweisungen und bietet Beispiele aus der Praxis, um das Lernen zu erleichtern. Einige Nutzer wiesen jedoch auf Probleme mit der Datenverfügbarkeit auf empfohlenen Websites hin und waren der Meinung, dass bestimmte technische Aspekte, insbesondere im Zusammenhang mit R, unterrepräsentiert waren.
Vorteile:⬤ Sehr praktisch und umfassend
⬤ ausgezeichnet für Anfänger
⬤ enthält Schritt-für-Schritt-Anleitungen und Beispiele aus dem wirklichen Leben
⬤ gut für den Unterricht
⬤ in sich geschlossen und deckt verschiedene RNAseq-Tools und -Methoden ab.
⬤ Auf einige Datensätze konnte nicht zugegriffen werden
⬤ deckt möglicherweise nicht jedes relevante Tool ab
⬤ unterrepräsentierter Abschnitt über R
⬤ mehr auf Bioinformatiker als auf Wissenschaftler im Nasslabor ausgerichtet.
(basierend auf 15 Leserbewertungen)
Rna-Seq Data Analysis: A Practical Approach
Der Stand der Technik bei der Transkriptomanalyse RNA-Sequenzierungsdaten (RNA-seq) bieten beispiellose Informationen über das Transkriptom, aber die Nutzung dieser Informationen mit Bioinformatik-Tools ist normalerweise ein Engpass. Mit RNA-seq Data Analysis: A Practical Approach können Forscher die unterschiedliche Expression auf Gen-, Exon- und Transkriptebene untersuchen und neue Gene, Transkripte und ganze Transkriptome entdecken.
Jedes Kapitel beginnt mit dem theoretischen Hintergrund, gefolgt von Beschreibungen relevanter Analysetools und praktischen Beispielen. Die Beispiele sind sowohl für Bioinformatiker als auch für nicht programmierende Wissenschaftler im Nasslabor zugänglich und veranschaulichen die Verwendung von Kommandozeilen-Tools, R und anderen Open-Source-Tools, wie der grafischen Software Chipster.
Dieser in sich geschlossene Leitfaden führt den Leser durch den gesamten Datenanalyse-Workflow und bietet einen detaillierten Überblick über die wichtigsten RNA-seq-Datenanalysemethoden und erklärt, wie man sie in der Praxis einsetzt. Es eignet sich für Forscher mit unterschiedlichem Hintergrund, einschließlich Biologie, Medizin, Genetik und Computerwissenschaften. Das Buch kann auch in einem Kurs für Graduierte oder fortgeschrittene Studenten verwendet werden.
| ISBN: | 9781466595002 |
| Autor: | |
| Verlag: | |
| Einband: | Hardcover |
| Erscheinungsjahr: | 2014 |
| Seitenzahl: | 322 |
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