
Systems Analytics and Integration of Big Omics Data
Ein "Genotyp" ist im Wesentlichen die gesamte Erbinformation eines Organismus, die er von seinen Eltern erhält. Ein "Phänotyp" sind die tatsächlich beobachteten physischen und Verhaltenseigenschaften eines Organismus.
Dazu gehören Merkmale wie Morphologie, Größe, Höhe, Augenfarbe, Stoffwechsel usw. Eine der größten Herausforderungen in der Computer- und Systembiologie ist die Vorhersage von Genotyp zu Phänotyp. Dies ist angesichts der durch moderne Omics-Technologien erzeugten Datenmengen eine Herausforderung.
Diese "Big Data" sind so groß und komplex, dass herkömmliche Datenverarbeitungsanwendungen dieser Aufgabe nicht gewachsen sind. Herausforderungen ergeben sich bei der Sammlung, Analyse, Auswertung, gemeinsamen Nutzung, Übertragung, Visualisierung, Archivierung und Integration dieser Daten.
In dieser Sonderausgabe liegt der Schwerpunkt auf der Analyse von Omics-Daten auf Systemebene, den jüngsten Entwicklungen in der Gen-Ontologie-Annotation und den Fortschritten in der Biologie der biologischen Pfade und der Netzwerkbiologie. Die Integration von Omics-Daten mit klinischen und biomedizinischen Daten durch maschinelles Lernen wird untersucht.
Diese Sonderausgabe befasst sich mit neuen Methoden im Zusammenhang mit Wechselwirkungen zwischen Genen und Umwelt, gewebespezifischer Genexpression und dem Einfluss externer Faktoren oder der Genetik des Wirts auf das Mikrobiom.