Bioinformatik mit Python Kochbuch

Bewertung:   (4,5 von 5)

Bioinformatik mit Python Kochbuch (Tiago Antao)

Leserbewertungen

Zusammenfassung:

Das Buch ist eine umfassende Ressource für alle, die sich mit computergestützter Biologie befassen, wobei der Schwerpunkt auf praktischen Anwendungen von Python in der Bioinformatik liegt. Es deckt eine Vielzahl von Themen ab, darunter Sequenzierung der nächsten Generation, Populationsgenetik und Proteinstruktur, und bietet Codebeispiele und Erklärungen. Es erfordert jedoch ein mittleres bis hohes Verständnis von Python und eine gewisse Vertrautheit mit der Terminologie der Bioinformatik.

Vorteile:

Umfassende Abdeckung verschiedener Bereiche der computergestützten Biologie.
Bietet praktische Hinweise zur Python-Programmierung und Code-Beispiele.
Aktueller und gut strukturierter Inhalt.
Klare und prägnante Darstellung der Materialien.
Geeignet für fortgeschrittene Anwender in der Bioinformatik.

Nachteile:

Erfordert Vorkenntnisse in Python und bioinformatischer Terminologie.
Nicht geeignet für Anfänger in Python oder Bioinformatik.
Kapitel 1 über die Software-Installation könnte von einigen Benutzern mit Vorkenntnissen als unnötig erachtet werden.

(basierend auf 6 Leserbewertungen)

Originaltitel:

Bioinformatics with Python Cookbook

Inhalt des Buches:

Lernen Sie, wie Sie moderne Python-Bioinformatik-Bibliotheken und -Anwendungen nutzen können, um Spitzenforschung in der computergestützten Biologie zu betreiben

Über dieses Buch

Entdecken und erlernen Sie die wichtigsten Python-Bibliotheken und -Anwendungen, um komplexe bioinformatische Analysen durchzuführen. Der Schwerpunkt liegt auf den modernsten Werkzeugen für die Forschung in den Bereichen Next Generation Sequencing, Genomics, Populationsgenetik, Phylogenomics und Proteomics anhand von Beispielen aus der Praxis.

Für wen ist dieses Buch geeignet?

Wenn Sie über Python-Kenntnisse auf mittlerem Niveau verfügen und mit den wichtigsten Forschungsergebnissen und dem Vokabular in Ihrem Bioinformatik-Thema vertraut sind, wird Ihnen dieses Buch helfen, Ihr Wissen weiter auszubauen.

Was Sie lernen werden

Sie gewinnen ein tiefes Verständnis der grundlegenden Bioinformatik-Bibliotheken von Python und lernen die wichtigsten Data-Science-Tools in Python kennen. Sie verarbeiten genomweite Daten mit Biopython. Sie analysieren und führen Qualitätskontrollen an Next-Generation-Sequencing-Datensätzen mit Bibliotheken wie PyVCF oder PySAM durch. Sie nutzen DendroPy und Biopython für phylogenetische Analysen. Sie führen populationsgenetische Analysen an großen Datensätzen durch. Sie simulieren komplexe Demografien und genomische Merkmale mit simuPOP.

Im Detail

Wenn Sie entweder ein Biologe oder ein Python-Programmierer sind, werden Sie wahrscheinlich mit dem Ausdruck „explosives Wachstum, aufregende Zeiten“ etwas anfangen können. Python ist wohl die wichtigste Programmiersprache für Big Data, und die Flut von Daten in der Biologie, vor allem aus der Genomik und Proteomik, macht die Bioinformatik zu einem der aufregendsten Bereiche der Datenwissenschaft.

Mit den praktischen Rezepten in diesem Buch werden Sie in der Lage sein, mit Python praktische Forschungen und Analysen in der computergestützten Biologie durchzuführen. Wir behandeln moderne Sequenzierungsbibliotheken der nächsten Generation und zeigen anhand von Beispielen aus der Praxis, wie man mit echten Daten umgeht. Der Schwerpunkt des Buches liegt auf der praktischen Anwendung der Bioinformatik, aber wir behandeln auch moderne Programmiertechniken und Frameworks zur Bewältigung der ständig wachsenden Flut von Bioinformatikdaten.

Weitere Daten des Buches:

ISBN:9781782175117
Autor:
Verlag:
Sprache:Englisch
Einband:Taschenbuch

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