Bioinformatik mit Python Kochbuch - Zweite Ausgabe: Lernen Sie, wie Sie moderne Python-Bioinformatik-Bibliotheken und -Anwendungen nutzen können, um modernste Forschung zu betreiben

Bewertung: ⭐⭐⭐⭐⭐  (4,3 von 5)

Leserbewertungen

Zusammenfassung:

Das Buch bietet aufschlussreiche Schritt-für-Schritt-Anleitungen für Bioinformatik-Projekte mit Python und richtet sich an Leser mit einigen Vorkenntnissen. Aufgrund der vorausgesetzten Kenntnisse und des veralteten Codes ist es jedoch nicht für Anfänger geeignet.

Vorteile:

Aufschlussreiche und detaillierte Anleitungen zu fortgeschrittenen Bioinformatik-Projekten. Gut für Leser mit Vorkenntnissen in Bioinformatik und Python. Behandelt modernste Anwendungen in Biopython.

Nachteile:

Setzt Vorkenntnisse in Python und Bioinformatik voraus und ist daher für Anfänger nicht geeignet. Der Code ist veraltet und einige verwendete Bibliotheken sind nicht mehr zugänglich. Probleme mit dem Zustand des Buches bei der Lieferung.

(basierend auf 4 Leserbewertungen)

Originaltitel:

Bioinformatics with Python Cookbook - Second Edition: Learn how to use modern Python bioinformatics libraries and applications to do cutting-edge rese

Inhalt des Buches:

Entdecken Sie moderne Sequenzierungsbibliotheken der nächsten Generation aus dem Python-Ökosystem, um große Mengen an biologischen Daten zu analysieren.

Hauptmerkmale

⬤ Durchführen komplexer bioinformatischer Analysen mit den wichtigsten Python-Bibliotheken und -Anwendungen.

⬤ Implementieren Sie Sequenzierung der nächsten Generation, Metagenomik, automatisierte Analysen, Populationsgenetik und mehr.

⬤ Erforschen Sie verschiedene statistische und maschinelle Lerntechniken für die bioinformatische Datenanalyse.

Buchbeschreibung

Die Bioinformatik ist ein aktives Forschungsgebiet, das eine Reihe von einfachen bis fortgeschrittenen Berechnungen einsetzt, um wertvolle Informationen aus biologischen Daten zu gewinnen.

Dieses Buch behandelt Sequenzierung der nächsten Generation, Genomik, Metagenomik, Populationsgenetik, Phylogenetik und Proteomik. Sie lernen moderne Programmiertechniken kennen, um große Mengen biologischer Daten zu analysieren. Anhand von Beispielen aus der Praxis konvertieren, analysieren und visualisieren Sie Datensätze mit verschiedenen Python-Tools und -Bibliotheken.

Dieses Buch hilft Ihnen, die Arbeit mit dem Galaxy-Server, dem am weitesten verbreiteten webbasierten Pipeline-System der Bioinformatik, besser zu verstehen. Diese aktualisierte Ausgabe enthält auch fortgeschrittene Filtertechniken für die Sequenzierung der nächsten Generation. Sie werden auch Themen wie die SNP-Entdeckung mit statistischen Ansätzen unter Hochleistungs-Computing-Frameworks wie Dask und Spark erforschen.

Am Ende dieses Buches werden Sie in der Lage sein, moderne Programmiertechniken und Frameworks zu verwenden und zu implementieren, um die ständig wachsende Flut von Bioinformatikdaten zu bewältigen.

(Was Sie lernen werden)

⬤ Lernen Sie, wie Sie große Next-Generation-Sequencing (NGS)-Datensätze verarbeiten können.

⬤ Arbeiten mit genomischen Datensätzen unter Verwendung der Formate FASTQ, BAM und VCF.

⬤ Lernen Sie, Sequenzvergleiche und phylogenetische Rekonstruktionen durchzuführen.

⬤ Komplexe Analysen mit protemischen Daten durchführen.

⬤ Python zur Interaktion mit Galaxy-Servern verwenden.

⬤ High-Performance-Computing-Techniken mit Dask und Spark anwenden.

⬤ Interaktionen von Proteindatensätzen mit Cytoscape visualisieren.

⬤ PCA und Entscheidungsbäume, zwei Techniken des maschinellen Lernens, mit biologischen Datensätzen anwenden.

Weitere Daten des Buches:

• ISBN: 9781789344691
• Autor: Tiago Antao
• Verlag: Packt Pub
• Einband: Taschenbuch