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Understanding Molecular Simulation: From Algorithms to Applications
Molekulare Simulation verstehen: Von Algorithmen zu Anwendungen erklärt die Physik hinter den Rezepten der molekularen Simulation für die Materialwissenschaft.
Seit der ersten Auflage vor nur fünf Jahren hat sich die Simulationswelt erheblich verändert, und die aktuellen Techniken sind ausgereift, wobei neue hinzugekommen sind. Die Abschnitte konzentrieren sich auf Übergangspfad-Sampling und diffusives Überschreiten von Barrieren, um seltene Ereignisse zu simulieren, dissipative Teilchendynamik als Simulationstechnik mit Verlaufsgraden, neuartige Schemata zur Berechnung von weitreichenden Kräften, Hamiltonianische und nicht-Hamiltonianische Dynamik im Zusammenhang mit Molekulardynamiksimulationen bei konstanter Temperatur und konstantem Druck, Algorithmen mit mehreren Zeitschritten als Alternative zu Beschränkungen und vieles mehr.
Weitere Abschnitte befassen sich mit Defekten in Festkörpern, dem „pruned-enriched Rosenbluth sampling“, dem „recoil-growth“ und konzertierten Rotationen für komplexe Moleküle, der parallelen Temperierung für glasartige Hamiltonianer, sowie mit Beispielen, die aktuelle Anwendungen hervorheben. Die Codes der Fallstudien sind im World Wide Web verfügbar.